兩 百 多 年 前 的 日 本 ， 因 幕 末 到 明 治 時 代 的 變 遷 而 陷 入 混 亂 ， 維 新 志 士 中 有 一 名 極 強 的 武 士 ， 為 開 創 新 時 代 而 殺 人 無 數 ， 人 們 稱 他 為 拔 刀 千 人 斬 ， 在 動 亂 結 束 ， 踏 入 明 治 時 代 以 後 ， 拔 刀 千 人 斬 忽 然 消 失 於 人 群 中 . . . . . .

　 明 治 十 一 年 的 東 京 下 町 ， 出 現 一 名 自 稱 拔 刀 千 人 斬 的 人 ， 此 人 冒 充 神 谷 活 心 流 的 弟 子 ， 在 東 京 濫 傷 無 辜 。 神 谷 道 場 的 代 師 父 神 谷 薰 在 門 下 弟 子 一 一 求 去 後 ， 決 心 討 伐 此 殺 手 ， 途 中 巧 遇 手 持 逆 刃 刀 的 浪 人 緋 村 劍 心 ， 在 劍 心 的 幫 助 下 ， 查 出 此 為 比 留 間 兄 弟 為 奪 取 神 谷 道 場 的 土 地 ， 而 假 冒 拔 刀 千 人 斬 以 破 壞 神 谷 道 活 心 流 的 名 譽 。 劍 心 助 薰 擊 退 比 留 間 兄 弟 ， 同 時 薰 也 發 現 ， 劍 心 才 是 真 正 的 拔 刀 千 人 斬 。

　 在 薰 的 慰 留 下 ， 劍 心 決 定 留 在 神 谷 道 場 ， 助 薰 重 建 神 谷 活 心 流 。 在 長 久 相 處 後 ， 薰 漸 漸 瞭 解 在 開 創 治 明 新 世 代 中 功 不 可 沒 的 劍 心 ， 放 棄 了 高 官 厚 祿 ， 以 不 殺 人 的 方 式 努 力 守 候 人 民 幸 福 的 理 想 。

　 一 日 ， 劍 心 從 流 氓 手 中 救 出 士 族 少 年 明 神 彌 彥 ， 劍 心 見 彌 彥 一 心 想 變 強 以 守 護 父 母 的 名 節 ， 遂 令 其 拜 神 谷 薰 為 師 。 高 傲 的 彌 彥 原 本 只 想 跟 劍 心 學 習 劍 術 ， 在 瞭 解 薰 以 活 人 劍 救 人 的 理 想 後 ， 願 意 向 薰 學 習 劍 術 ， 在 假 拔 刀 齋 事 件 後 門 下 弟 子 一 一 離 去 的 神 谷 道 場 ， 終 於 再 有 了 第 一 名 弟 子 。

　 逃 獄 後 的 比 留 間 兄 弟 ， 雇 用 以 打 架 為 業 的 打 手 相 樂 左 之 助 來 幫 他 們 打 敗 劍 心 。 痛 恨 維 新 志 士 的 左 之 助 在 得 知 劍 心 的 真 實 身 份 後 ， 決 心 盡 全 力 打 倒 劍 心 ， 一 場 決 鬥 就 此 展 開 . . . . .

下續卷二